甲状腺肿瘤主要分为上皮源性肿瘤和非上皮源性肿瘤,其中上皮源性肿瘤占甲状腺肿瘤的95%~99%,来源于滤泡上皮细胞;非上皮源性肿瘤多起源于淋巴组织;另有极少部分肿瘤起源于间叶组织,又称间叶源性肿瘤,占比不足0.5%。软组织透明细胞肉瘤(CCSST)作为特殊类型的间叶源性肿瘤更为罕见,且预后较差。国内外尚未见原发性甲状腺CCSST相关病例的报道。本文作者报道1例原发性甲状腺CCSST患者,其肿瘤经基因检测证实伴有EWSR1基因重排(22q12断裂),并进行相关文献复习,总结其临床特点与诊疗经验。患者,女性,57岁,10余年前因甲状腺功能亢进症行核素治疗后定期复查,1年前体检发现甲状腺结节,进一步评估后入院行甲状腺双叶全切除术。术后石蜡病理和免疫组织化学检测提示肿瘤细胞S-100及性别决定区Y框蛋白10(SOX10)阳性和人黑色素瘤抗原45(HMB45)阴性,荧光原位杂交(FISH)技术检测证实存在EWSR1基因重排(22q12断裂),明确诊断为原发性甲状腺CCSST伴EWSR1基因重排;术后正电子发射断层显像-计算机断层扫描(PET-CT)检查排除全身其他部位转移。临床工作中,对于特殊类型甲状腺肿瘤患者的罕见基因(EWSR1基因等)应予以重视,并制定个体化诊疗方案及随访计划,以实现肿瘤早期识别和精准干预,从而改善患者长期预后。